APOBEC1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
APOBEC1
Ідентифікатори
Символи APOBEC1, APOBEC-1, BEDP, CDAR1, HEPR, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1
Зовнішні ІД OMIM: 600130 MGI: 103298 HomoloGene: 1243 GeneCards: APOBEC1
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_005889
NM_001304566
NM_001644
NM_001134391
NM_031159
RefSeq (білок)
NP_001291495
NP_001635
NP_005880
NP_001127863
NP_112436
Локус (UCSC) Хр. 12: 7.65 – 7.67 Mb Хр. 6: 122.55 – 122.58 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

APOBEC1 (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 236 амінокислот, а молекулярна маса — 28 192[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MTSEKGPSTGDPTLRRRIEPWEFDVFYDPRELRKEACLLYEIKWGMSRKI
WRSSGKNTTNHVEVNFIKKFTSERDFHPSMSCSITWFLSWSPCWECSQAI
REFLSRHPGVTLVIYVARLFWHMDQQNRQGLRDLVNSGVTIQIMRASEYY
HCWRNFVNYPPGDEAHWPQYPPLWMMLYALELHCIILSLPPCLKISRRWQ
NHLTFFRLHLQNCHYQTIPPHILLATGLIHPSVAWR

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі як процесінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Hadjiagapiou C., Giannoni F., Funahashi T., Skarosi S.F., Davidson N.O. (1994). Molecular cloning of a human small intestinal apolipoprotein B mRNA editing protein. Nucleic Acids Res. 22: 1874—1879. PMID 8208612 DOI:10.1093/nar/22.10.1874
  • Lau P.P., Zhu H.-J., Baldini A., Charnsangavej C., Chan L. (1994). Dimeric structure of a human apolipoprotein B mRNA editing protein and cloning and chromosomal localization of its gene. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 8522—8526. PMID 8078915 DOI:10.1073/pnas.91.18.8522
  • Fujino T., Navaratnam N., Scott J. (1998). Human apolipoprotein B RNA editing deaminase gene (APOBEC1). Genomics. 47: 266—275. PMID 9479499 DOI:10.1006/geno.1997.5110
  • Lau P.P., Zhu H.J., Nakamuta M., Chan L. (1997). Cloning of an Apobec-1-binding protein that also interacts with apolipoprotein B mRNA and evidence for its involvement in RNA editing. J. Biol. Chem. 272: 1452—1455. PMID 8999813 DOI:10.1074/jbc.272.3.1452
  • Lau P.P., Chang B.-H., Chan L. (2001). Two-hybrid cloning identifies an RNA-binding protein, GRY-RBP, as a component of apobec-1 editosome. Biochem. Biophys. Res. Commun. 282: 977—983. PMID 11352648 DOI:10.1006/bbrc.2001.4679
  • Hirano K., Min J., Funahashi T., Baunoch D.A., Davidson N.O. (1997). Characterization of the human apobec-1 gene: expression in gastrointestinal tissues determined by alternative splicing with production of a novel truncated peptide. J. Lipid Res. 38: 847—859. PMID 9186903

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:604 (англ.) . Архів оригіналу за 12 березня 2016. Процитовано 22 серпня 2017.
  4. UniProt, P41238 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]