RBMY1A1

RBMY1A1
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2FY1
Ідентифікатори
Символи	RBMY1A1, RBM, RBM1, RBM2, RBMY, RBMY1C, YRRM1, YRRM2, RNA binding motif protein, Y-linked, family 1, member A1, RNA binding motif protein Y-linked family 1 member A1
Зовнішні ІД	OMIM: 400006 HomoloGene: 121598 GeneCards: RBMY1A1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • RNA binding • nucleic acid binding Клітинна компонента • клітинне ядро • nuclear speck Біологічний процес • mRNA processing • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • Сплайсинг РНК • mRNA cis splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5940	н/д
Ensembl	ENSG00000234414	н/д
UniProt	P0DJD3	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_005058 NM_001320944 NM_001320945	н/д
RefSeq (білок)	NP_001307873 NP_001307874 NP_005049 NP_001006120 NP_001307878 NP_001307879	н/д
Локус (UCSC)	Хр. Y: 21.51 – 21.55 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

RBMY1A1 (англ. RNA binding motif protein, Y-linked, family 1, member A1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на Y-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 496 амінокислот, а молекулярна маса — 55 784.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVEADHPGKL		FIGGLNRETN		EKMLKAVFGK		HGPISEVLLI		KDRTSKSRGF
AFITFENPAD		AKNAAKDMNG		KSLHGKAIKV		EQAKKPSFQS		GGRRRPPASS
RNRSPSGSLR		SARGSRGGTR		GWLPSHEGHL		DDGGYTPDLK		MSYSRGLIPV
KRGPSSRSGG		PPPKKSAPSA		VARSNSWMGS		QGPMSQRREN		YGVPPRRATI
SSWRNDRMST		RHDGYATNDG		NHPSCQETRD		YAPPSRGYAY		RDNGHSNRDE
HSSRGYRNHR		SSRETRDYAP		PSRGHAYRDY		GHSRRDESYS		RGYRNRRSSR
ETREYAPPSR		GHGYRDYGHS		RRHESYSRGY		RNHPSSRETR		DYAPPHRDYA
YRDYGHSSWD		EHSSRGYSYH		DGYGEALGRD		HSEHLSGSSY		RDALQRYGTS
HGAPPARGPR		MSYGGSTCHA		YSNTRDRYGR		SWESYSSCGD		FHYCDREHVC
RKDQRNPPSL		GRVLPDPREA		CGSSSYVASI		VDGGESRSEK		GDSSRY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hofmann Y., Wirth B. (2002). hnRNP-G promotes exon 7 inclusion of survival motor neuron (SMN) via direct interaction with Htra2-beta1. Hum. Mol. Genet. 11: 2037—2049. PMID 12165565 DOI:10.1093/hmg/11.17.2037
• Elliott D.J. (2004). The role of potential splicing factors including RBMY, RBMX, hnRNPG-T and STAR proteins in spermatogenesis. Int. J. Androl. 27: 328—334. PMID 15595951 DOI:10.1111/j.1365-2605.2004.00496.x

Див. також

• Хромосома Y