Дагоберто Фонтес народився в місті Мальдонадо. У дорослому футболі дебютував 1965 року виступами за команду «Дефенсор Спортінг», у складі якої грав протягом 7 років до 1971 року, був одним із основних гравців атакувальної ланки команди. У 1972 році перейшов до мексиканського клубу «Пуебла», в якому грав протягом двох років. Завершив кар'єру в іншому мексиканському клубі УАНЛ «Тигрес», у якому провів сезон 1974—1975 років.
1968 року дебютував в офіційних матчах у складі національної збірної Уругваю. У складі збірної був учасником чемпіонату світу 1970 року у Мексиці. Загалом протягом кар'єри у національній команді, яка тривала 3 роки, провів у її формі 13 матчів, забитими м'ячами у складі збірної не відзначився.