CLCNKA

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
CLCNKA
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи CLCNKA, CLCK1, ClC-K1, hClC-Ka, chloride voltage-gated channel Ka
Зовнішні ІД OMIM: 602024 MGI: 1930643 HomoloGene: 107317 GeneCards: CLCNKA
Пов'язані генетичні захворювання
Bartter disease type 4b[1]
Реагує на сполуку
niflumic acid, DIDS[2]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_004070
NM_001042704
NM_001257139
NM_019701
RefSeq (білок)
NP_001036169
NP_001244068
NP_004061
NP_062675
Локус (UCSC) Хр. 1: 16.02 – 16.03 Mb Хр. 4: 141.13 – 141.14 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CLCNKA (англ. Chloride voltage-gated channel Ka) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 687 амінокислот, а молекулярна маса — 75 285[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEELVGLREGFSGDPVTLQELWGPCPHIRRAIQGGLEWLKQKVFRLGEDW
YFLMTLGVLMALVSYAMNFAIGCVVRAHQWLYREIGDSHLLRYLSWTVYP
VALVSFSSGFSQSITPSSGGSGIPELKTMLAGVILEDYLDIKNFGAKVVG
LSCTLATGSTLFLGKVGPFVHLSVMIAAYLGRVRTTTIGEPENKSKQNEM
LVAAAAVGVATVFAAPFSGVLFSIEVMSSHFSVRDYWRGFFAATCGAFIF
RLLAVFNSEQETITSLYKTSFRVDVPFDLPEIFFFVALGGICGVLSCAYL
FCQRTFLSFIKTNRYSSKLLATSKPVYSALATLLLASITYPPGVGHFLAS
RLSMKQHLDSLFDNHSWALMTQNSSPPWPEELDPQHLWWEWYHPRFTIFG
TLAFFLVMKFWMLILATTIPMPAGYFMPIFILGAAIGRLLGEALAVAFPE
GIVTGGVTNPIMPGGYALAGAAAFSGAVTHTISTALLAFELTGQIVHALP
VLMAVLAANAIAQSCQPSFYDGTIIVKKLPYLPRILGRNIGSHHVRVEHF
MNHSITTLAKDTPLEEVVKVVTSTDVTEYPLVESTESQILVGIVQRAQLV
QALQAEPPSRAPGHQQCLQDILARGCPTEPVTLTLFSETTLHQAQNLFKL
LNLQSLFVTSRGRAVGCVSWVEMKKAISNLTNPPAPK

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, хлорних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, хлоридом. Локалізований у мембрані.

Література

[ред. | ред. код]
  • Kieferle S., Fong P., Bens M., Vandewalle A., Jentsch T. (1994). Two highly homologous members of the ClC chloride channel family in both rat and human kidney. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 6943—6947. PMID 8041726 DOI:10.1073/pnas.91.15.6943
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Gradogna A., Fenollar-Ferrer C., Forrest L.R., Pusch M. (2012). Dissecting a regulatory calcium-binding site of CLC-K kidney chloride channels. J. Gen. Physiol. 140: 681—696. PMID 23148261 DOI:10.1085/jgp.201210878
  • Markovic S., Dutzler R. (2007). The structure of the cytoplasmic domain of the chloride channel ClC-Ka reveals a conserved interaction interface. Structure. 15: 715—725. PMID 17562318 DOI:10.1016/j.str.2007.04.013

Примітки

[ред. | ред. код]

Див. також

[ред. | ред. код]